自動檢測和活性花粉計數
一定條件下,低花粉活力可能限制葡萄產量,而造成葡萄種植者的經濟損失。通常通過對花粉粒染色過程中存在的可活的和不可存活的花粉粒數量來進行評估。盡管人工計數是最簡單和最敏感的方法,但這是一項費時費力的過程。因此,新的基于圖像的方法可以幫助客觀、準確和具有成本效益的表型這些特征。
作者介紹PollenCounter,用于高通量的花粉活力的表型分析工具。該工具將著色的花粉粒的RGB圖像分割成其主通道,保留紅色和綠色的分割圖像(分別包含總的和僅存活的花粉顆粒的信息),以便隨后對感興趣區域(花粉粒)進行分離和計數。該框架成功地用于分析大量收集的葡萄品種樣品的花粉活力。結果顯示,具有非常低的花粉生活力的品種(如Corinto Bianco;存活力:14.1±1.3%)與其他具有非常低的不育花粉粒(Cuelga;存活率:98.2±0.5%)的品種具有很大的遺傳變異性。在幾個克隆的無性系中也觀察到了廣泛的變異性。Tempranillo Tinto(第一季從97.9±0.9到60.6±5.9%)。有趣的是,第二季對這個性狀的評估揭示了不同的基因型對環境的敏感性。
兩種典型低、高活性花粉樣本的原始圖像和處理圖像
PollenCounter的使用將有助于不同領域,包括遺傳學研究、作物改良和育種策略,這些都需要快速、精確和準確的結果??紤]到它的靈活性,它不僅可以用于葡萄,還可以用于其他種類的花粉粒的鑒別染色。在一個物種層面上觀察到的廣泛的表型多樣性,以及對特定品種和克隆的鑒定在這一性狀上有很大的差異,為進一步的分析在葡萄藤中雄性不育的生理和遺傳原因奠定了基礎。
關鍵詞:計算機視覺,植物表型工具
來源:Plant Methods. 9 January 2018.A new image-based tool for the high throughput phenotyping of pollen viability: evaluation of inter- and intra-cultivar diversity in grapevine.Javier Tello, María Ignacia Montemayor, Astrid Forneck and Javier Ibá?ez.