如果我們想要了解環境如何塑造生物的外觀和行為，我們需要比較不同基因組成和環境經驗的個體群體。對于復雜的表型特征，如人體的姿勢或面部表情，比較并不簡單，因為一些影響因素無法輕易地在個體間量化或平均。因此, 用計算方法來重建具有代表性的原型, 使用一系列的算法來填補缺失信息和計算手段。同樣的問題也適用于植物的根系統體系結構 (RSA)。一些計算機程序可用于從根圖像中提取數值數據, 但通常不提供自定義的數據分析或 RSA 的可視化重建。
EZ-Root-VIS綜述
本文作者開發了Root-VIS，一款免費的軟件工具，可以在用戶選擇的根映像集中幫助確定許多RSA特性的均值和方差。此外，Root-VIS提供了幾種選項，可以根據平均數據生成根系統的可視化重建，從而實現篩選和建模。作者通過對擬南芥（Arabidopsis thaliana）的全基因組關聯研究證實了Root-VIS與新版EZ-Rhizo的適用性，可用于快速表征基因型-環境相互作用和基因發現。
擬南芥在不同營養條件下的RSA性狀
全基因組關聯研究的根系結構特征
來源：Plant Physiology.EZ-Root-VIS: A Software Pipeline for the Rapid Analysis and Visual Reconstruction of Root System Architecture.Zaigham Shahzad, Fabian Kellermeier, Emily M. Armstrong, Simon Rogers, Guillaume Lobet, Anna Amtmann, Adrian Hills.
